Fiji: Procesamiento de imágenes para biotecnología y toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Visión general de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica
• Comprensión de la arquitectura y los complementos (plugins) de ImageJ
• Instalación y configuración de Fiji para obtener un rendimiento óptimo

Técnicas básicas de procesamiento de imágenes

• Formatos de adquisición e importación de imágenes
• Ajuste del contraste y el brillo, y aplicación de filtros
• Apilamiento y métodos de proyección de imágenes

Análisis avanzado de imágenes

• Técnicas de segmentación: umbralización y detección de bordes
• Recuento de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas

Trabajo con muestras biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, células sanguíneas y algas
• Desconvolución de color y análisis de tejidos teñidos
• Análisis de series temporales y seguimiento del movimiento celular

Automatización y personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas
• Uso de complementos (plugins) de Fiji para análisis especializados
• Introducción a la programación con el lenguaje de macro de ImageJ (IJM)

Gestión de datos e informes

• Exportación de resultados y generación de informes
• Anotación de imágenes y preparación de datos para publicación
• Mejores prácticas para un análisis de imágenes reproducible

Resumen y próximos pasos