Fiji: Procesamiento de Imágenes para Biotecnología y Toxicología

Introducción a Fiji e ImageJ

• Vista general de Fiji y sus aplicaciones en la investigación científica
• Comprensión de la arquitectura de ImageJ y sus complementos (plugins)
• Instalación y configuración de Fiji para un rendimiento óptimo

Técnicas Básicas de Procesamiento de Imágenes

• Adquisición de imágenes y formatos de importación
• Ajuste de contraste, brillo y aplicación de filtros
• Métodos de apilamiento (stacking) y proyección de imágenes

Análisis Avanzado de Imágenes

• Técnicas de segmentación: umbralización (thresholding) y detección de bordes
• Conteo de objetos y análisis de partículas en muestras histológicas
• Medición de áreas, perímetros y otras características morfológicas

Trabajo con Muestras Biológicas

• Procesamiento de imágenes de tejidos histológicos, células sanguíneas y algas
• Desconvolución de color y análisis de tejidos teñidos
• Análisis en secuencia temporal (time-lapse) y seguimiento del movimiento celular

Automatización y Personalización

• Creación y ejecución de macros para tareas repetitivas
• Uso de complementos (plugins) de Fiji para análisis especializados
• Scripting básico con el Lenguaje de Macros de ImageJ (IJM)

Gestión de Datos e Informes

• Exportación de resultados y generación de informes
• Anotación de imágenes y preparación de datos para publicación
• Mejores prácticas para un análisis de imágenes reproducible